熒光是一種分子現(xiàn)象，一種物質(zhì)吸收某種顏色的光，與此同時(shí)輻射另外一種顏色的光，后者能量更低，波長更長，這種過程被稱為激發(fā)和發(fā)射，很多物質(zhì)都會(huì)表現(xiàn)出一定的熒光特征。在早期，觀察的都是初級(jí)熒光或自發(fā)熒光，但是現(xiàn)在已經(jīng)開發(fā)出許多染料，他們能夠發(fā)出很亮的熒光，可以用來給樣品某些部分染色，這種方法叫次級(jí)或間接熒光，這些染料叫熒光染料，當(dāng)與抗體和核酸等其他有機(jī)物質(zhì)軛和時(shí)，稱為熒光探針和熒光團(tuán)。

偏光顯微鏡也叫礦相顯微鏡或礦石顯微鏡。是將普通光改變?yōu)槠窆膺M(jìn)行鏡檢的顯微鏡，以鑒別某一物質(zhì)是單折射（各向同性）或雙折射性（各向異性），可做單偏光觀察，正交偏光觀察，錐光觀察。偏光顯微鏡在地質(zhì)學(xué)、生物學(xué)、材料科學(xué)等領(lǐng)域有著廣泛的應(yīng)用。

金相顯微鏡（又稱工業(yè)檢測顯微鏡）主要集中在材料科學(xué)領(lǐng)域，?特別是金屬材料的研究。?通過金相顯微鏡，?可觀察（金相）材料的顯微組織、低倍組織和斷口組織，反映材料的相和組織組成物、晶粒（亦包括可能存在的亞晶）、非金屬夾雜物乃至某些晶體缺陷（例如位錯(cuò)）的數(shù)量、形貌、大小、分布、取向、空間排布狀態(tài)等。

暗場觀察是一種利用傾斜照明來增強(qiáng)樣品在正常照明條件下成像不佳的對(duì)比度的技術(shù)，在直射光被聚光鏡中的不透明光闌遮擋后，從傾斜角度穿過樣品的光線被衍射、折射并反射到顯微鏡物鏡中，以形成疊加在深色背景上的標(biāo)本的明亮圖像。

明場觀察是顯微鏡的基礎(chǔ)觀察方式，利用可見光作為顯微鏡的照明光源，光線直接照射在樣品上進(jìn)行成像。明場觀察有透射照明和反射照明兩種方式，透射照明適合觀察透明薄的樣品，而反射照明適合不透明的樣品。

熒光原位雜交（Fluorescence In Situ Hybridization，F(xiàn)ISH）是臨床病理檢測中廣泛運(yùn)用的一種分子細(xì)胞遺傳學(xué)診斷技術(shù)，其原理是用熒光染料直接或間接標(biāo)記的DNA核酸探針與待測樣本中的DNA核酸序列按照堿基互補(bǔ)配對(duì)的原則進(jìn)行雜交，然后通過熒光顯微鏡觀察熒光信號(hào)位置、數(shù)量等來判斷待測序列的缺失、擴(kuò)增及易位等情況。